Wer sich auch wundern sollte, warum beim Ausführen von Javaprogrammen, welche SWT einsetzen, via Webstart unter MacOS X seltsame Dinge geschehen und ein stabiler Lauf nahezu unmöglich ist, sollte sich folgenden Bugreport zu Gemüte führen:
Das VM-Argument -XstartOnFirstThread, welches für den Start von SWT-Programmen unter MacOS nötig ist, wird vom Webstart-Client momentan leider nicht angenommen und an die VM weitergereicht – auch wenn dieses in der JNLP-Datei korrekt mittels

<j2se version="1.5+" java-vm-args="-XstartOnFirstThread"/>

angegeben wird.
Abhilfe schafft erst Leopard bzw. ein kommendes Update für Tiger (Zeitpunkt unbekannt) — bis dahin ist erstmal Essig mit SWT via Webstart…